农村污水治理三年行动计划确定了“五个原则”，即政府主导原则、集中优先原则、因地制宜原则、经济实用原则和资源利用原则。提倡采用生物组合处理技术，实现污染物的生物降解和氮、磷的生态去除，加强生活污水消减和尾水的回收利用，满足循环利用和生态农业的需要。同时，明确县(市)区为农村生活污水治理的责任主体，镇(乡、街道)为组织实施主体。
按照“政府扶持、社会参与、群众自筹”资金筹措原则，加大资金投入。市级财政在2014至2016年间，每年新增安排财政资金2.8亿元，实行年度专项一般转移支付的以奖代补政策，对完成年度工作目标任务的县(市)区进行资金补助。积极倡导村企结对，发动民间力量，吸纳社会资本。
